Protein–RNA interactions for Protein: P18340

Cxcl9, C-X-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl9P18340 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cxcl9P18340 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cxcl9P18340 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cxcl9P18340 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cxcl9P18340 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cxcl9P18340 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cxcl9P18340 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cxcl9P18340 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cxcl9P18340 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cxcl9P18340 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cxcl9P18340 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cxcl9P18340 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cxcl9P18340 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cxcl9P18340 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cxcl9P18340 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cxcl9P18340 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cxcl9P18340 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cxcl9P18340 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cxcl9P18340 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cxcl9P18340 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cxcl9P18340 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cxcl9P18340 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cxcl9P18340 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cxcl9P18340 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cxcl9P18340 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cxcl9P18340 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cxcl9P18340 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cxcl9P18340 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cxcl9P18340 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cxcl9P18340 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cxcl9P18340 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cxcl9P18340 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cxcl9P18340 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cxcl9P18340 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cxcl9P18340 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cxcl9P18340 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cxcl9P18340 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cxcl9P18340 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cxcl9P18340 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cxcl9P18340 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cxcl9P18340 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cxcl9P18340 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cxcl9P18340 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cxcl9P18340 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cxcl9P18340 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cxcl9P18340 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cxcl9P18340 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cxcl9P18340 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cxcl9P18340 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cxcl9P18340 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cxcl9P18340 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cxcl9P18340 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cxcl9P18340 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cxcl9P18340 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cxcl9P18340 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cxcl9P18340 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cxcl9P18340 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cxcl9P18340 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cxcl9P18340 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cxcl9P18340 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cxcl9P18340 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cxcl9P18340 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cxcl9P18340 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cxcl9P18340 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cxcl9P18340 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cxcl9P18340 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cxcl9P18340 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cxcl9P18340 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cxcl9P18340 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cxcl9P18340 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cxcl9P18340 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cxcl9P18340 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cxcl9P18340 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cxcl9P18340 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cxcl9P18340 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cxcl9P18340 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cxcl9P18340 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cxcl9P18340 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cxcl9P18340 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cxcl9P18340 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cxcl9P18340 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cxcl9P18340 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cxcl9P18340 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cxcl9P18340 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cxcl9P18340 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cxcl9P18340 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cxcl9P18340 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cxcl9P18340 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cxcl9P18340 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cxcl9P18340 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cxcl9P18340 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cxcl9P18340 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cxcl9P18340 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cxcl9P18340 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cxcl9P18340 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cxcl9P18340 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cxcl9P18340 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cxcl9P18340 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cxcl9P18340 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cxcl9P18340 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms