Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pou4f1P17208 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pou4f1P17208 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pou4f1P17208 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pou4f1P17208 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pou4f1P17208 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pou4f1P17208 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pou4f1P17208 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pou4f1P17208 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pou4f1P17208 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pou4f1P17208 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pou4f1P17208 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pou4f1P17208 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pou4f1P17208 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pou4f1P17208 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pou4f1P17208 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pou4f1P17208 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pou4f1P17208 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Pou4f1P17208 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pou4f1P17208 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pou4f1P17208 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pou4f1P17208 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pou4f1P17208 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pou4f1P17208 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pou4f1P17208 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pou4f1P17208 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pou4f1P17208 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Pou4f1P17208 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pou4f1P17208 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pou4f1P17208 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pou4f1P17208 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pou4f1P17208 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pou4f1P17208 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pou4f1P17208 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pou4f1P17208 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pou4f1P17208 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pou4f1P17208 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pou4f1P17208 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pou4f1P17208 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pou4f1P17208 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pou4f1P17208 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pou4f1P17208 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pou4f1P17208 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pou4f1P17208 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pou4f1P17208 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pou4f1P17208 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pou4f1P17208 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pou4f1P17208 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pou4f1P17208 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pou4f1P17208 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pou4f1P17208 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pou4f1P17208 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pou4f1P17208 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pou4f1P17208 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pou4f1P17208 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pou4f1P17208 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pou4f1P17208 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pou4f1P17208 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pou4f1P17208 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms