Protein–RNA interactions for Protein: P15620

Znf271, Zinc finger protein 271, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf271P15620 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znf271P15620 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znf271P15620 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znf271P15620 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znf271P15620 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf271P15620 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf271P15620 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf271P15620 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf271P15620 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf271P15620 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf271P15620 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf271P15620 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf271P15620 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf271P15620 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf271P15620 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf271P15620 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf271P15620 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf271P15620 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf271P15620 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf271P15620 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf271P15620 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf271P15620 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf271P15620 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf271P15620 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf271P15620 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf271P15620 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf271P15620 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf271P15620 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf271P15620 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf271P15620 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf271P15620 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf271P15620 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf271P15620 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf271P15620 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf271P15620 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf271P15620 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf271P15620 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf271P15620 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf271P15620 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Znf271P15620 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Znf271P15620 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Znf271P15620 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Znf271P15620 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Znf271P15620 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Znf271P15620 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Znf271P15620 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf271P15620 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf271P15620 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf271P15620 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf271P15620 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf271P15620 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf271P15620 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf271P15620 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf271P15620 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf271P15620 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf271P15620 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf271P15620 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf271P15620 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf271P15620 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf271P15620 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf271P15620 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf271P15620 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf271P15620 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf271P15620 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf271P15620 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf271P15620 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf271P15620 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf271P15620 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf271P15620 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf271P15620 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf271P15620 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf271P15620 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf271P15620 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf271P15620 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf271P15620 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf271P15620 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf271P15620 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf271P15620 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf271P15620 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf271P15620 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf271P15620 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf271P15620 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf271P15620 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf271P15620 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf271P15620 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf271P15620 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf271P15620 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf271P15620 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf271P15620 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf271P15620 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf271P15620 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf271P15620 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf271P15620 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf271P15620 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf271P15620 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf271P15620 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf271P15620 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf271P15620 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf271P15620 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf271P15620 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms