Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga5P11688 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga5P11688 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga5P11688 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga5P11688 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga5P11688 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga5P11688 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga5P11688 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga5P11688 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga5P11688 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga5P11688 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga5P11688 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga5P11688 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga5P11688 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga5P11688 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga5P11688 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga5P11688 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga5P11688 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga5P11688 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga5P11688 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga5P11688 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga5P11688 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga5P11688 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga5P11688 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga5P11688 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga5P11688 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga5P11688 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga5P11688 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga5P11688 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga5P11688 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga5P11688 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga5P11688 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga5P11688 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga5P11688 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga5P11688 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga5P11688 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga5P11688 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga5P11688 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga5P11688 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga5P11688 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga5P11688 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga5P11688 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga5P11688 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga5P11688 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga5P11688 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga5P11688 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga5P11688 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga5P11688 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga5P11688 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga5P11688 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga5P11688 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga5P11688 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga5P11688 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga5P11688 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itga5P11688 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga5P11688 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga5P11688 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga5P11688 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga5P11688 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga5P11688 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga5P11688 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga5P11688 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga5P11688 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itga5P11688 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga5P11688 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga5P11688 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga5P11688 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga5P11688 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga5P11688 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga5P11688 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga5P11688 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga5P11688 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga5P11688 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga5P11688 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga5P11688 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga5P11688 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga5P11688 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga5P11688 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga5P11688 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga5P11688 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga5P11688 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga5P11688 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga5P11688 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga5P11688 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga5P11688 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga5P11688 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga5P11688 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga5P11688 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga5P11688 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga5P11688 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga5P11688 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga5P11688 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga5P11688 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga5P11688 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga5P11688 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga5P11688 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga5P11688 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga5P11688 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga5P11688 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga5P11688 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms