Protein–RNA interactions for Protein: P01915

H-2 class II histocompatibility antigen, E-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01915 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01915 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01915 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01915 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01915 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01915 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01915 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01915 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01915 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01915 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01915 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01915 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01915 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01915 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01915 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01915 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01915 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01915 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01915 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01915 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01915 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01915 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01915 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01915 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01915 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01915 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01915 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01915 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01915 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01915 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01915 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01915 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01915 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01915 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01915 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01915 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01915 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01915 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01915 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01915 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01915 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01915 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01915 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01915 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01915 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01915 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01915 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01915 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01915 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01915 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01915 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01915 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01915 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01915 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01915 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01915 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01915 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01915 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01915 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01915 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01915 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01915 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01915 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01915 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01915 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01915 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01915 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01915 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01915 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01915 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01915 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01915 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01915 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01915 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01915 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01915 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01915 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01915 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01915 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01915 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01915 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01915 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01915 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01915 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01915 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01915 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01915 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01915 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01915 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01915 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01915 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01915 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01915 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01915 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01915 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01915 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01915 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01915 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01915 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01915 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms