Protein–RNA interactions for Protein: P01798

Ig heavy chain V-III region E109, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01798 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01798 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01798 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01798 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01798 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01798 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01798 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
P01798 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01798 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01798 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01798 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01798 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01798 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01798 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01798 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01798 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01798 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01798 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01798 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01798 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01798 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01798 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01798 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01798 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01798 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01798 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01798 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01798 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01798 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01798 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01798 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01798 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01798 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01798 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01798 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
P01798 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01798 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01798 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01798 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01798 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01798 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01798 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01798 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01798 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01798 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01798 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01798 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01798 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01798 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01798 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01798 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01798 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01798 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01798 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01798 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01798 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01798 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01798 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01798 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01798 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01798 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P01798 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P01798 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
P01798 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
P01798 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P01798 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01798 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17■□□□□ 0.31
P01798 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01798 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01798 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01798 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01798 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01798 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01798 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
P01798 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01798 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01798 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01798 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01798 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01798 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01798 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01798 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01798 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01798 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01798 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01798 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01798 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01798 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01798 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
P01798 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01798 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
P01798 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01798 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01798 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01798 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01798 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01798 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01798 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01798 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01798 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms