Protein–RNA interactions for Protein: P01798

Ig heavy chain V-III region E109, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01798 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01798 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01798 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01798 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01798 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01798 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01798 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
P01798 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01798 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01798 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01798 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01798 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01798 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01798 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01798 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01798 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01798 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01798 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01798 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01798 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01798 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01798 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01798 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01798 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01798 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01798 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01798 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01798 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01798 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01798 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01798 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01798 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01798 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01798 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01798 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
P01798 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01798 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01798 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01798 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01798 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01798 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01798 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01798 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01798 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01798 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01798 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01798 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01798 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01798 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01798 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01798 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01798 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01798 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01798 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01798 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01798 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01798 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01798 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01798 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01798 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01798 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P01798 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P01798 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
P01798 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
P01798 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P01798 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01798 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17■□□□□ 0.31
P01798 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01798 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01798 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01798 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01798 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01798 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01798 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
P01798 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01798 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01798 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01798 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01798 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01798 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01798 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01798 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01798 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01798 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01798 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01798 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01798 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01798 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01798 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
P01798 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01798 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
P01798 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01798 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01798 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01798 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01798 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01798 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01798 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01798 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01798 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms