Protein–RNA interactions for Protein: P01738

T-cell receptor alpha chain V region PHDS58, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01738 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01738 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01738 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01738 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01738 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01738 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01738 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01738 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01738 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01738 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P01738 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01738 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01738 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01738 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01738 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01738 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01738 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01738 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01738 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01738 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01738 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01738 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01738 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01738 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01738 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01738 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01738 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01738 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01738 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01738 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01738 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01738 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01738 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01738 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P01738 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P01738 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01738 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01738 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01738 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01738 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01738 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01738 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01738 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01738 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01738 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01738 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01738 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01738 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01738 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01738 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01738 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01738 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01738 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01738 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01738 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01738 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01738 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01738 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01738 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01738 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01738 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01738 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01738 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01738 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01738 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01738 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01738 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01738 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01738 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01738 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01738 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01738 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01738 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01738 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01738 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01738 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01738 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01738 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
P01738 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01738 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01738 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01738 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01738 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01738 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01738 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01738 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01738 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01738 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01738 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01738 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01738 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01738 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01738 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01738 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01738 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01738 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01738 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
P01738 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01738 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01738 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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