Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01641 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01641 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01641 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01641 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01641 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01641 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01641 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01641 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01641 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01641 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01641 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
P01641 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01641 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01641 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01641 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01641 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01641 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01641 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01641 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01641 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01641 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01641 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01641 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
P01641 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
P01641 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01641 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01641 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01641 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01641 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01641 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01641 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01641 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01641 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01641 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01641 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01641 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01641 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
P01641 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01641 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01641 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01641 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01641 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01641 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01641 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01641 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01641 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01641 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01641 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01641 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01641 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01641 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01641 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01641 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
P01641 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01641 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
P01641 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01641 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01641 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
P01641 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01641 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01641 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01641 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01641 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01641 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01641 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01641 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01641 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01641 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01641 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01641 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01641 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01641 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01641 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01641 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01641 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01641 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01641 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01641 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01641 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01641 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01641 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01641 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01641 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01641 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01641 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01641 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01641 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01641 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01641 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01641 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01641 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
P01641 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01641 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01641 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01641 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01641 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01641 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01641 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01641 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms