Protein–RNA interactions for Protein: P00860

Odc1, Ornithine decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odc1P00860 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Odc1P00860 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Odc1P00860 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Odc1P00860 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Odc1P00860 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Odc1P00860 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Odc1P00860 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Odc1P00860 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Odc1P00860 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Odc1P00860 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Odc1P00860 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Odc1P00860 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Odc1P00860 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Odc1P00860 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Odc1P00860 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Odc1P00860 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Odc1P00860 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Odc1P00860 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Odc1P00860 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Odc1P00860 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Odc1P00860 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Odc1P00860 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Odc1P00860 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Odc1P00860 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Odc1P00860 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Odc1P00860 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Odc1P00860 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Odc1P00860 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Odc1P00860 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Odc1P00860 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Odc1P00860 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Odc1P00860 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Odc1P00860 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Odc1P00860 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Odc1P00860 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Odc1P00860 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Odc1P00860 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Odc1P00860 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Odc1P00860 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Odc1P00860 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Odc1P00860 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Odc1P00860 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Odc1P00860 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Odc1P00860 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Odc1P00860 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Odc1P00860 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Odc1P00860 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Odc1P00860 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Odc1P00860 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Odc1P00860 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Odc1P00860 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Odc1P00860 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Odc1P00860 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms