Protein–RNA interactions for Protein: O89001

Cpd, Carboxypeptidase D, mousemouse

Predictions only

Length 1,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CpdO89001 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CpdO89001 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CpdO89001 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CpdO89001 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CpdO89001 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CpdO89001 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CpdO89001 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CpdO89001 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CpdO89001 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CpdO89001 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CpdO89001 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CpdO89001 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CpdO89001 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CpdO89001 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CpdO89001 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CpdO89001 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CpdO89001 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CpdO89001 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CpdO89001 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CpdO89001 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CpdO89001 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CpdO89001 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CpdO89001 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CpdO89001 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CpdO89001 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CpdO89001 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CpdO89001 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CpdO89001 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CpdO89001 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CpdO89001 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CpdO89001 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CpdO89001 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CpdO89001 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CpdO89001 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CpdO89001 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CpdO89001 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CpdO89001 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CpdO89001 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CpdO89001 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CpdO89001 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CpdO89001 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CpdO89001 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CpdO89001 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CpdO89001 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CpdO89001 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CpdO89001 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CpdO89001 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CpdO89001 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CpdO89001 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CpdO89001 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CpdO89001 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CpdO89001 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CpdO89001 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CpdO89001 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CpdO89001 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CpdO89001 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CpdO89001 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CpdO89001 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CpdO89001 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CpdO89001 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CpdO89001 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CpdO89001 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CpdO89001 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CpdO89001 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CpdO89001 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CpdO89001 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CpdO89001 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CpdO89001 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CpdO89001 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CpdO89001 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CpdO89001 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CpdO89001 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CpdO89001 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CpdO89001 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CpdO89001 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CpdO89001 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CpdO89001 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CpdO89001 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CpdO89001 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CpdO89001 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CpdO89001 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CpdO89001 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CpdO89001 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CpdO89001 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CpdO89001 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CpdO89001 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CpdO89001 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CpdO89001 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CpdO89001 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CpdO89001 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CpdO89001 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CpdO89001 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CpdO89001 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CpdO89001 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CpdO89001 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CpdO89001 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CpdO89001 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CpdO89001 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CpdO89001 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CpdO89001 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms