Protein–RNA interactions for Protein: O88552

Cldn2, Claudin-2, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn2O88552 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn2O88552 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn2O88552 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn2O88552 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn2O88552 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn2O88552 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn2O88552 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn2O88552 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn2O88552 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn2O88552 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn2O88552 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn2O88552 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn2O88552 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn2O88552 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn2O88552 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn2O88552 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn2O88552 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn2O88552 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn2O88552 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn2O88552 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn2O88552 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn2O88552 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn2O88552 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn2O88552 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn2O88552 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn2O88552 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn2O88552 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn2O88552 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn2O88552 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn2O88552 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn2O88552 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn2O88552 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn2O88552 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn2O88552 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn2O88552 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn2O88552 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn2O88552 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn2O88552 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn2O88552 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn2O88552 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn2O88552 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn2O88552 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn2O88552 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn2O88552 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn2O88552 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn2O88552 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn2O88552 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn2O88552 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn2O88552 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Cldn2O88552 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn2O88552 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn2O88552 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn2O88552 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn2O88552 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn2O88552 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn2O88552 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn2O88552 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn2O88552 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn2O88552 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn2O88552 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn2O88552 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn2O88552 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn2O88552 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn2O88552 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn2O88552 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn2O88552 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn2O88552 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn2O88552 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn2O88552 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn2O88552 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn2O88552 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn2O88552 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn2O88552 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn2O88552 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn2O88552 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn2O88552 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn2O88552 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn2O88552 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn2O88552 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn2O88552 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn2O88552 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn2O88552 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn2O88552 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn2O88552 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn2O88552 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn2O88552 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn2O88552 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn2O88552 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn2O88552 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn2O88552 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn2O88552 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn2O88552 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn2O88552 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn2O88552 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn2O88552 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn2O88552 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn2O88552 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn2O88552 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn2O88552 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn2O88552 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms