Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PrxO55103 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PrxO55103 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PrxO55103 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PrxO55103 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PrxO55103 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PrxO55103 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PrxO55103 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PrxO55103 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PrxO55103 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PrxO55103 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PrxO55103 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PrxO55103 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PrxO55103 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PrxO55103 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PrxO55103 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PrxO55103 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PrxO55103 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PrxO55103 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PrxO55103 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PrxO55103 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PrxO55103 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PrxO55103 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PrxO55103 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PrxO55103 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PrxO55103 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PrxO55103 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PrxO55103 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PrxO55103 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PrxO55103 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PrxO55103 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PrxO55103 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PrxO55103 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PrxO55103 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PrxO55103 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PrxO55103 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PrxO55103 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PrxO55103 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PrxO55103 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PrxO55103 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PrxO55103 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PrxO55103 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PrxO55103 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PrxO55103 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PrxO55103 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PrxO55103 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PrxO55103 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PrxO55103 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PrxO55103 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PrxO55103 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PrxO55103 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PrxO55103 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PrxO55103 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PrxO55103 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PrxO55103 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PrxO55103 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PrxO55103 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PrxO55103 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PrxO55103 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PrxO55103 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PrxO55103 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PrxO55103 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PrxO55103 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PrxO55103 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PrxO55103 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PrxO55103 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PrxO55103 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PrxO55103 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PrxO55103 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PrxO55103 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PrxO55103 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PrxO55103 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PrxO55103 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PrxO55103 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PrxO55103 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PrxO55103 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PrxO55103 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PrxO55103 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PrxO55103 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PrxO55103 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PrxO55103 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PrxO55103 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PrxO55103 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PrxO55103 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PrxO55103 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PrxO55103 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PrxO55103 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PrxO55103 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
PrxO55103 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
PrxO55103 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
PrxO55103 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PrxO55103 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PrxO55103 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PrxO55103 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PrxO55103 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PrxO55103 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PrxO55103 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PrxO55103 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PrxO55103 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PrxO55103 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms