Protein–RNA interactions for Protein: O35738

Klf12, Krueppel-like factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf12O35738 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf12O35738 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf12O35738 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf12O35738 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf12O35738 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf12O35738 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf12O35738 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf12O35738 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms