Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2-ObO35424 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms