Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Barx2O08686 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Barx2O08686 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Barx2O08686 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Barx2O08686 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Barx2O08686 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Barx2O08686 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Barx2O08686 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Barx2O08686 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Barx2O08686 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Barx2O08686 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Barx2O08686 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Barx2O08686 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Barx2O08686 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Barx2O08686 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Barx2O08686 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Barx2O08686 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Barx2O08686 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Barx2O08686 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Barx2O08686 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Barx2O08686 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Barx2O08686 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Barx2O08686 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Barx2O08686 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Barx2O08686 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Barx2O08686 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Barx2O08686 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Barx2O08686 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Barx2O08686 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Barx2O08686 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Barx2O08686 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Barx2O08686 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Barx2O08686 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Barx2O08686 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Barx2O08686 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Barx2O08686 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Barx2O08686 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Barx2O08686 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Barx2O08686 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Barx2O08686 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Barx2O08686 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Barx2O08686 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Barx2O08686 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Barx2O08686 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Barx2O08686 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Barx2O08686 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Barx2O08686 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Barx2O08686 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Barx2O08686 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Barx2O08686 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Barx2O08686 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Barx2O08686 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Barx2O08686 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Barx2O08686 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Barx2O08686 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Barx2O08686 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Barx2O08686 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Barx2O08686 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Barx2O08686 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Barx2O08686 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Barx2O08686 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Barx2O08686 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Barx2O08686 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Barx2O08686 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Barx2O08686 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Barx2O08686 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Barx2O08686 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Barx2O08686 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Barx2O08686 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Barx2O08686 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Barx2O08686 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Barx2O08686 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Barx2O08686 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Barx2O08686 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Barx2O08686 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Barx2O08686 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Barx2O08686 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Barx2O08686 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Barx2O08686 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Barx2O08686 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Barx2O08686 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Barx2O08686 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Barx2O08686 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Barx2O08686 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Barx2O08686 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Barx2O08686 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Barx2O08686 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Barx2O08686 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Barx2O08686 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Barx2O08686 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Barx2O08686 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Barx2O08686 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Barx2O08686 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Barx2O08686 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Barx2O08686 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Barx2O08686 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Barx2O08686 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Barx2O08686 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Barx2O08686 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Barx2O08686 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms