Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Pot1bH7BX60 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Pot1bH7BX60 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pot1bH7BX60 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pot1bH7BX60 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pot1bH7BX60 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pot1bH7BX60 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pot1bH7BX60 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pot1bH7BX60 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pot1bH7BX60 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pot1bH7BX60 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pot1bH7BX60 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pot1bH7BX60 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pot1bH7BX60 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pot1bH7BX60 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pot1bH7BX60 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pot1bH7BX60 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pot1bH7BX60 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pot1bH7BX60 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pot1bH7BX60 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pot1bH7BX60 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pot1bH7BX60 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pot1bH7BX60 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pot1bH7BX60 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pot1bH7BX60 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pot1bH7BX60 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pot1bH7BX60 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pot1bH7BX60 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pot1bH7BX60 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pot1bH7BX60 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pot1bH7BX60 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pot1bH7BX60 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pot1bH7BX60 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pot1bH7BX60 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pot1bH7BX60 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pot1bH7BX60 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pot1bH7BX60 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms