Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnf148G3X9R7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms