Protein–RNA interactions for Protein: G3UW59

Ubap1l, MCG16443, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubap1lG3UW59 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ubap1lG3UW59 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ubap1lG3UW59 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ubap1lG3UW59 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ubap1lG3UW59 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ubap1lG3UW59 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ubap1lG3UW59 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ubap1lG3UW59 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ubap1lG3UW59 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ubap1lG3UW59 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Ubap1lG3UW59 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ubap1lG3UW59 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ubap1lG3UW59 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Ubap1lG3UW59 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ubap1lG3UW59 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ubap1lG3UW59 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ubap1lG3UW59 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ubap1lG3UW59 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ubap1lG3UW59 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ubap1lG3UW59 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ubap1lG3UW59 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ubap1lG3UW59 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ubap1lG3UW59 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ubap1lG3UW59 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ubap1lG3UW59 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ubap1lG3UW59 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ubap1lG3UW59 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ubap1lG3UW59 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ubap1lG3UW59 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ubap1lG3UW59 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ubap1lG3UW59 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ubap1lG3UW59 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ubap1lG3UW59 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ubap1lG3UW59 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ubap1lG3UW59 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ubap1lG3UW59 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ubap1lG3UW59 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ubap1lG3UW59 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ubap1lG3UW59 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ubap1lG3UW59 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ubap1lG3UW59 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ubap1lG3UW59 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ubap1lG3UW59 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ubap1lG3UW59 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ubap1lG3UW59 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ubap1lG3UW59 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ubap1lG3UW59 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ubap1lG3UW59 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ubap1lG3UW59 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ubap1lG3UW59 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ubap1lG3UW59 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ubap1lG3UW59 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ubap1lG3UW59 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ubap1lG3UW59 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ubap1lG3UW59 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ubap1lG3UW59 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ubap1lG3UW59 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ubap1lG3UW59 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ubap1lG3UW59 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ubap1lG3UW59 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ubap1lG3UW59 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ubap1lG3UW59 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ubap1lG3UW59 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ubap1lG3UW59 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ubap1lG3UW59 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ubap1lG3UW59 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ubap1lG3UW59 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ubap1lG3UW59 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ubap1lG3UW59 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ubap1lG3UW59 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ubap1lG3UW59 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ubap1lG3UW59 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ubap1lG3UW59 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ubap1lG3UW59 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ubap1lG3UW59 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ubap1lG3UW59 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ubap1lG3UW59 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ubap1lG3UW59 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ubap1lG3UW59 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ubap1lG3UW59 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ubap1lG3UW59 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ubap1lG3UW59 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ubap1lG3UW59 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ubap1lG3UW59 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ubap1lG3UW59 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ubap1lG3UW59 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ubap1lG3UW59 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ubap1lG3UW59 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ubap1lG3UW59 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Ubap1lG3UW59 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ubap1lG3UW59 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ubap1lG3UW59 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ubap1lG3UW59 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ubap1lG3UW59 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ubap1lG3UW59 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ubap1lG3UW59 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ubap1lG3UW59 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ubap1lG3UW59 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ubap1lG3UW59 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ubap1lG3UW59 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms