Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ9

Bicra, BRD4-interacting chromatin-remodeling complex-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BicraF8VPZ9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
BicraF8VPZ9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
BicraF8VPZ9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
BicraF8VPZ9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
BicraF8VPZ9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC37.03■■■■□ 3.52
BicraF8VPZ9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
BicraF8VPZ9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
BicraF8VPZ9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
BicraF8VPZ9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
BicraF8VPZ9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
BicraF8VPZ9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
BicraF8VPZ9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
BicraF8VPZ9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
BicraF8VPZ9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
BicraF8VPZ9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
BicraF8VPZ9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
BicraF8VPZ9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
BicraF8VPZ9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
BicraF8VPZ9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC37■■■■□ 3.51
BicraF8VPZ9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC37■■■■□ 3.51
BicraF8VPZ9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC37■■■■□ 3.51
BicraF8VPZ9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC37■■■■□ 3.51
BicraF8VPZ9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC37■■■■□ 3.51
BicraF8VPZ9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC37■■■■□ 3.51
BicraF8VPZ9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC37■■■■□ 3.51
BicraF8VPZ9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
BicraF8VPZ9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC37■■■■□ 3.51
BicraF8VPZ9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
BicraF8VPZ9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
BicraF8VPZ9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
BicraF8VPZ9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
BicraF8VPZ9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
BicraF8VPZ9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
BicraF8VPZ9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
BicraF8VPZ9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
BicraF8VPZ9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
BicraF8VPZ9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
BicraF8VPZ9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
BicraF8VPZ9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
BicraF8VPZ9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
BicraF8VPZ9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
BicraF8VPZ9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
BicraF8VPZ9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
BicraF8VPZ9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
BicraF8VPZ9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
BicraF8VPZ9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
BicraF8VPZ9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
BicraF8VPZ9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
BicraF8VPZ9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
BicraF8VPZ9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
BicraF8VPZ9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
BicraF8VPZ9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
BicraF8VPZ9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
BicraF8VPZ9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
BicraF8VPZ9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
BicraF8VPZ9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
BicraF8VPZ9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
BicraF8VPZ9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
BicraF8VPZ9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
BicraF8VPZ9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
BicraF8VPZ9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
BicraF8VPZ9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC36.93■■■■□ 3.5
BicraF8VPZ9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
BicraF8VPZ9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
BicraF8VPZ9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
BicraF8VPZ9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
BicraF8VPZ9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
BicraF8VPZ9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
BicraF8VPZ9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
BicraF8VPZ9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
BicraF8VPZ9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
BicraF8VPZ9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
BicraF8VPZ9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
BicraF8VPZ9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
BicraF8VPZ9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
BicraF8VPZ9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
BicraF8VPZ9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
BicraF8VPZ9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
BicraF8VPZ9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
BicraF8VPZ9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
BicraF8VPZ9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
BicraF8VPZ9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
BicraF8VPZ9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
BicraF8VPZ9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
BicraF8VPZ9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
BicraF8VPZ9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
BicraF8VPZ9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC36.88■■■■□ 3.49
BicraF8VPZ9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
BicraF8VPZ9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
BicraF8VPZ9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
BicraF8VPZ9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
BicraF8VPZ9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
BicraF8VPZ9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
BicraF8VPZ9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
BicraF8VPZ9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
BicraF8VPZ9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
BicraF8VPZ9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
BicraF8VPZ9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
BicraF8VPZ9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
BicraF8VPZ9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms