Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Ercc6F8VPZ5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Ercc6F8VPZ5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Ercc6F8VPZ5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
Ercc6F8VPZ5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Ercc6F8VPZ5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Ercc6F8VPZ5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Ercc6F8VPZ5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Ercc6F8VPZ5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Ercc6F8VPZ5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Ercc6F8VPZ5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Ercc6F8VPZ5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Ercc6F8VPZ5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Ercc6F8VPZ5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Ercc6F8VPZ5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Ercc6F8VPZ5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
Ercc6F8VPZ5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Ercc6F8VPZ5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Ercc6F8VPZ5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Ercc6F8VPZ5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Ercc6F8VPZ5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Ercc6F8VPZ5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Ercc6F8VPZ5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Ercc6F8VPZ5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Ercc6F8VPZ5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
Ercc6F8VPZ5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Ercc6F8VPZ5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Ercc6F8VPZ5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Ercc6F8VPZ5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Ercc6F8VPZ5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Ercc6F8VPZ5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Ercc6F8VPZ5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Ercc6F8VPZ5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Ercc6F8VPZ5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Ercc6F8VPZ5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Ercc6F8VPZ5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Ercc6F8VPZ5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Ercc6F8VPZ5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Ercc6F8VPZ5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Ercc6F8VPZ5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Ercc6F8VPZ5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
Ercc6F8VPZ5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Ercc6F8VPZ5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Ercc6F8VPZ5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Ercc6F8VPZ5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
Ercc6F8VPZ5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Ercc6F8VPZ5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Ercc6F8VPZ5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Ercc6F8VPZ5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Ercc6F8VPZ5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Ercc6F8VPZ5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Ercc6F8VPZ5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Ercc6F8VPZ5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Ercc6F8VPZ5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Ercc6F8VPZ5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Ercc6F8VPZ5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Ercc6F8VPZ5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Ercc6F8VPZ5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ercc6F8VPZ5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ercc6F8VPZ5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ercc6F8VPZ5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ercc6F8VPZ5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ercc6F8VPZ5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ercc6F8VPZ5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ercc6F8VPZ5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ercc6F8VPZ5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ercc6F8VPZ5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Ercc6F8VPZ5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Ercc6F8VPZ5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Ercc6F8VPZ5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Ercc6F8VPZ5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Ercc6F8VPZ5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Ercc6F8VPZ5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
Ercc6F8VPZ5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Ercc6F8VPZ5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Ercc6F8VPZ5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Ercc6F8VPZ5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Ercc6F8VPZ5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Ercc6F8VPZ5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Ercc6F8VPZ5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Ercc6F8VPZ5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
Ercc6F8VPZ5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Ercc6F8VPZ5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Ercc6F8VPZ5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Ercc6F8VPZ5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Ercc6F8VPZ5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Ercc6F8VPZ5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC35■■■■□ 3.19
Ercc6F8VPZ5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
Ercc6F8VPZ5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Ercc6F8VPZ5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Ercc6F8VPZ5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Ercc6F8VPZ5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Ercc6F8VPZ5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Ercc6F8VPZ5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Ercc6F8VPZ5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Ercc6F8VPZ5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Ercc6F8VPZ5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Ercc6F8VPZ5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Ercc6F8VPZ5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
Ercc6F8VPZ5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms