Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Farp1F8VPU2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Farp1F8VPU2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Farp1F8VPU2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Farp1F8VPU2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Farp1F8VPU2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Farp1F8VPU2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Farp1F8VPU2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Farp1F8VPU2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Farp1F8VPU2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Farp1F8VPU2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Farp1F8VPU2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Farp1F8VPU2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Farp1F8VPU2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Farp1F8VPU2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Farp1F8VPU2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Farp1F8VPU2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Farp1F8VPU2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Farp1F8VPU2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Farp1F8VPU2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Farp1F8VPU2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Farp1F8VPU2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Farp1F8VPU2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Farp1F8VPU2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Farp1F8VPU2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Farp1F8VPU2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Farp1F8VPU2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Farp1F8VPU2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Farp1F8VPU2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Farp1F8VPU2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Farp1F8VPU2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Farp1F8VPU2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Farp1F8VPU2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Farp1F8VPU2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Farp1F8VPU2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Farp1F8VPU2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Farp1F8VPU2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Farp1F8VPU2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Farp1F8VPU2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Farp1F8VPU2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Farp1F8VPU2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Farp1F8VPU2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Farp1F8VPU2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Farp1F8VPU2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Farp1F8VPU2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Farp1F8VPU2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Farp1F8VPU2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Farp1F8VPU2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Farp1F8VPU2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Farp1F8VPU2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Farp1F8VPU2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Farp1F8VPU2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Farp1F8VPU2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Farp1F8VPU2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Farp1F8VPU2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Farp1F8VPU2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Farp1F8VPU2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Farp1F8VPU2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Farp1F8VPU2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Farp1F8VPU2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Farp1F8VPU2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Farp1F8VPU2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Farp1F8VPU2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Farp1F8VPU2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Farp1F8VPU2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Farp1F8VPU2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Farp1F8VPU2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Farp1F8VPU2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Farp1F8VPU2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Farp1F8VPU2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Farp1F8VPU2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Farp1F8VPU2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Farp1F8VPU2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Farp1F8VPU2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Farp1F8VPU2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Farp1F8VPU2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Farp1F8VPU2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Farp1F8VPU2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Farp1F8VPU2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Farp1F8VPU2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Farp1F8VPU2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Farp1F8VPU2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Farp1F8VPU2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Farp1F8VPU2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Farp1F8VPU2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Farp1F8VPU2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Farp1F8VPU2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Farp1F8VPU2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Farp1F8VPU2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Farp1F8VPU2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Farp1F8VPU2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Farp1F8VPU2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Farp1F8VPU2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Farp1F8VPU2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Farp1F8VPU2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Farp1F8VPU2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Farp1F8VPU2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Farp1F8VPU2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms