Protein–RNA interactions for Protein: F6XX07

Gm21970, Predicted gene 21970 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21970F6XX07 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21970F6XX07 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21970F6XX07 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21970F6XX07 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21970F6XX07 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21970F6XX07 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21970F6XX07 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21970F6XX07 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21970F6XX07 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21970F6XX07 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21970F6XX07 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21970F6XX07 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21970F6XX07 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21970F6XX07 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21970F6XX07 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21970F6XX07 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21970F6XX07 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21970F6XX07 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21970F6XX07 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21970F6XX07 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21970F6XX07 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21970F6XX07 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm21970F6XX07 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm21970F6XX07 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm21970F6XX07 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm21970F6XX07 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm21970F6XX07 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm21970F6XX07 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm21970F6XX07 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms