Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Urb2E9Q7L1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Urb2E9Q7L1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Urb2E9Q7L1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Urb2E9Q7L1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Urb2E9Q7L1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Urb2E9Q7L1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Urb2E9Q7L1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Urb2E9Q7L1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Urb2E9Q7L1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Urb2E9Q7L1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Urb2E9Q7L1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Urb2E9Q7L1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Urb2E9Q7L1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Urb2E9Q7L1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Urb2E9Q7L1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Urb2E9Q7L1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Urb2E9Q7L1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Urb2E9Q7L1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Urb2E9Q7L1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Urb2E9Q7L1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Urb2E9Q7L1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Urb2E9Q7L1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Urb2E9Q7L1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Urb2E9Q7L1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Urb2E9Q7L1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Urb2E9Q7L1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Urb2E9Q7L1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Urb2E9Q7L1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Urb2E9Q7L1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Urb2E9Q7L1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Urb2E9Q7L1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Urb2E9Q7L1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Urb2E9Q7L1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Urb2E9Q7L1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Urb2E9Q7L1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Urb2E9Q7L1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Urb2E9Q7L1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Urb2E9Q7L1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Urb2E9Q7L1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Urb2E9Q7L1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Urb2E9Q7L1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Urb2E9Q7L1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Urb2E9Q7L1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Urb2E9Q7L1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Urb2E9Q7L1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Urb2E9Q7L1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Urb2E9Q7L1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Urb2E9Q7L1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Urb2E9Q7L1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Urb2E9Q7L1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Urb2E9Q7L1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Urb2E9Q7L1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Urb2E9Q7L1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Urb2E9Q7L1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Urb2E9Q7L1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Urb2E9Q7L1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Urb2E9Q7L1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Urb2E9Q7L1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Urb2E9Q7L1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Urb2E9Q7L1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Urb2E9Q7L1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Urb2E9Q7L1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Urb2E9Q7L1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Urb2E9Q7L1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Urb2E9Q7L1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Urb2E9Q7L1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Urb2E9Q7L1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Urb2E9Q7L1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Urb2E9Q7L1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Urb2E9Q7L1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Urb2E9Q7L1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Urb2E9Q7L1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Urb2E9Q7L1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Urb2E9Q7L1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Urb2E9Q7L1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Urb2E9Q7L1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Urb2E9Q7L1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Urb2E9Q7L1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Urb2E9Q7L1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Urb2E9Q7L1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Urb2E9Q7L1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Urb2E9Q7L1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Urb2E9Q7L1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Urb2E9Q7L1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Urb2E9Q7L1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Urb2E9Q7L1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Urb2E9Q7L1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Urb2E9Q7L1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Urb2E9Q7L1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Urb2E9Q7L1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Urb2E9Q7L1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Urb2E9Q7L1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Urb2E9Q7L1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Urb2E9Q7L1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Urb2E9Q7L1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Urb2E9Q7L1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Urb2E9Q7L1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Urb2E9Q7L1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Urb2E9Q7L1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms