Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp31E9Q6Y8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp31E9Q6Y8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp31E9Q6Y8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp31E9Q6Y8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp31E9Q6Y8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp31E9Q6Y8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp31E9Q6Y8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp31E9Q6Y8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp31E9Q6Y8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp31E9Q6Y8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp31E9Q6Y8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp31E9Q6Y8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp31E9Q6Y8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp31E9Q6Y8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp31E9Q6Y8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp31E9Q6Y8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp31E9Q6Y8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp31E9Q6Y8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp31E9Q6Y8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp31E9Q6Y8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp31E9Q6Y8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp31E9Q6Y8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp31E9Q6Y8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Usp31E9Q6Y8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Usp31E9Q6Y8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp31E9Q6Y8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp31E9Q6Y8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp31E9Q6Y8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp31E9Q6Y8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp31E9Q6Y8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp31E9Q6Y8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp31E9Q6Y8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp31E9Q6Y8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp31E9Q6Y8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp31E9Q6Y8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp31E9Q6Y8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp31E9Q6Y8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp31E9Q6Y8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp31E9Q6Y8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp31E9Q6Y8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp31E9Q6Y8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp31E9Q6Y8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp31E9Q6Y8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp31E9Q6Y8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp31E9Q6Y8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp31E9Q6Y8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp31E9Q6Y8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp31E9Q6Y8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp31E9Q6Y8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp31E9Q6Y8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp31E9Q6Y8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp31E9Q6Y8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp31E9Q6Y8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp31E9Q6Y8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp31E9Q6Y8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp31E9Q6Y8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp31E9Q6Y8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp31E9Q6Y8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp31E9Q6Y8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp31E9Q6Y8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp31E9Q6Y8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp31E9Q6Y8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp31E9Q6Y8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp31E9Q6Y8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp31E9Q6Y8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp31E9Q6Y8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Usp31E9Q6Y8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp31E9Q6Y8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp31E9Q6Y8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp31E9Q6Y8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp31E9Q6Y8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp31E9Q6Y8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp31E9Q6Y8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp31E9Q6Y8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp31E9Q6Y8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp31E9Q6Y8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp31E9Q6Y8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp31E9Q6Y8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp31E9Q6Y8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp31E9Q6Y8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp31E9Q6Y8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Usp31E9Q6Y8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp31E9Q6Y8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp31E9Q6Y8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp31E9Q6Y8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp31E9Q6Y8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp31E9Q6Y8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp31E9Q6Y8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp31E9Q6Y8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp31E9Q6Y8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp31E9Q6Y8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp31E9Q6Y8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp31E9Q6Y8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp31E9Q6Y8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp31E9Q6Y8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp31E9Q6Y8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp31E9Q6Y8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp31E9Q6Y8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp31E9Q6Y8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms