Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc71lE9Q4T4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms