Protein–RNA interactions for Protein: E9Q236

Abcc4, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc4E9Q236 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abcc4E9Q236 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abcc4E9Q236 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abcc4E9Q236 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abcc4E9Q236 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abcc4E9Q236 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abcc4E9Q236 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abcc4E9Q236 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abcc4E9Q236 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abcc4E9Q236 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Abcc4E9Q236 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Abcc4E9Q236 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Abcc4E9Q236 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Abcc4E9Q236 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Abcc4E9Q236 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Abcc4E9Q236 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Abcc4E9Q236 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Abcc4E9Q236 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Abcc4E9Q236 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Abcc4E9Q236 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Abcc4E9Q236 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Abcc4E9Q236 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Abcc4E9Q236 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Abcc4E9Q236 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Abcc4E9Q236 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Abcc4E9Q236 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Abcc4E9Q236 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Abcc4E9Q236 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Abcc4E9Q236 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Abcc4E9Q236 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Abcc4E9Q236 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Abcc4E9Q236 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcc4E9Q236 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcc4E9Q236 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcc4E9Q236 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcc4E9Q236 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcc4E9Q236 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcc4E9Q236 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcc4E9Q236 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Abcc4E9Q236 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Abcc4E9Q236 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Abcc4E9Q236 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Abcc4E9Q236 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcc4E9Q236 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcc4E9Q236 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcc4E9Q236 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcc4E9Q236 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcc4E9Q236 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcc4E9Q236 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcc4E9Q236 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcc4E9Q236 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcc4E9Q236 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcc4E9Q236 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcc4E9Q236 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcc4E9Q236 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcc4E9Q236 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcc4E9Q236 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcc4E9Q236 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcc4E9Q236 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abcc4E9Q236 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abcc4E9Q236 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abcc4E9Q236 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abcc4E9Q236 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abcc4E9Q236 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abcc4E9Q236 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abcc4E9Q236 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abcc4E9Q236 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Abcc4E9Q236 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Abcc4E9Q236 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Abcc4E9Q236 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Abcc4E9Q236 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Abcc4E9Q236 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Abcc4E9Q236 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Abcc4E9Q236 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Abcc4E9Q236 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Abcc4E9Q236 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Abcc4E9Q236 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Abcc4E9Q236 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Abcc4E9Q236 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Abcc4E9Q236 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcc4E9Q236 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcc4E9Q236 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcc4E9Q236 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcc4E9Q236 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcc4E9Q236 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcc4E9Q236 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcc4E9Q236 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcc4E9Q236 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcc4E9Q236 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abcc4E9Q236 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abcc4E9Q236 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abcc4E9Q236 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abcc4E9Q236 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abcc4E9Q236 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abcc4E9Q236 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcc4E9Q236 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcc4E9Q236 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcc4E9Q236 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcc4E9Q236 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcc4E9Q236 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms