Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NebE9Q1W3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
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