Protein–RNA interactions for Protein: E9Q166

Atad2b, ATPase family, AAA domain-containing 2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2bE9Q166 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Atad2bE9Q166 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Atad2bE9Q166 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Atad2bE9Q166 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Atad2bE9Q166 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Atad2bE9Q166 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Atad2bE9Q166 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Atad2bE9Q166 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Atad2bE9Q166 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Atad2bE9Q166 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Atad2bE9Q166 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Atad2bE9Q166 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Atad2bE9Q166 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
Atad2bE9Q166 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Atad2bE9Q166 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Atad2bE9Q166 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Atad2bE9Q166 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Atad2bE9Q166 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Atad2bE9Q166 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Atad2bE9Q166 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Atad2bE9Q166 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Atad2bE9Q166 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Atad2bE9Q166 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Atad2bE9Q166 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Atad2bE9Q166 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Atad2bE9Q166 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Atad2bE9Q166 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Atad2bE9Q166 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
Atad2bE9Q166 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Atad2bE9Q166 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Atad2bE9Q166 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Atad2bE9Q166 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Atad2bE9Q166 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Atad2bE9Q166 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Atad2bE9Q166 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Atad2bE9Q166 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Atad2bE9Q166 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Atad2bE9Q166 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Atad2bE9Q166 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Atad2bE9Q166 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Atad2bE9Q166 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Atad2bE9Q166 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Atad2bE9Q166 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Atad2bE9Q166 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Atad2bE9Q166 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
Atad2bE9Q166 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
Atad2bE9Q166 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Atad2bE9Q166 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Atad2bE9Q166 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Atad2bE9Q166 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
Atad2bE9Q166 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
Atad2bE9Q166 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Atad2bE9Q166 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Atad2bE9Q166 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Atad2bE9Q166 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Atad2bE9Q166 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Atad2bE9Q166 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
Atad2bE9Q166 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Atad2bE9Q166 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Atad2bE9Q166 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Atad2bE9Q166 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Atad2bE9Q166 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Atad2bE9Q166 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
Atad2bE9Q166 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Atad2bE9Q166 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Atad2bE9Q166 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
Atad2bE9Q166 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Atad2bE9Q166 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Atad2bE9Q166 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Atad2bE9Q166 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Atad2bE9Q166 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Atad2bE9Q166 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
Atad2bE9Q166 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Atad2bE9Q166 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Atad2bE9Q166 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Atad2bE9Q166 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Atad2bE9Q166 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Atad2bE9Q166 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Atad2bE9Q166 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Atad2bE9Q166 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Atad2bE9Q166 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
Atad2bE9Q166 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
Atad2bE9Q166 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Atad2bE9Q166 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Atad2bE9Q166 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Atad2bE9Q166 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Atad2bE9Q166 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Atad2bE9Q166 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Atad2bE9Q166 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
Atad2bE9Q166 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Atad2bE9Q166 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Atad2bE9Q166 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Atad2bE9Q166 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Atad2bE9Q166 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Atad2bE9Q166 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Atad2bE9Q166 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
Atad2bE9Q166 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Atad2bE9Q166 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Atad2bE9Q166 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Atad2bE9Q166 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 629 ms