Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3095E9Q058 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3095E9Q058 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3095E9Q058 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3095E9Q058 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3095E9Q058 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3095E9Q058 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3095E9Q058 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3095E9Q058 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3095E9Q058 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3095E9Q058 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3095E9Q058 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3095E9Q058 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3095E9Q058 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3095E9Q058 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3095E9Q058 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3095E9Q058 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3095E9Q058 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3095E9Q058 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3095E9Q058 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3095E9Q058 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3095E9Q058 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3095E9Q058 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3095E9Q058 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3095E9Q058 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3095E9Q058 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3095E9Q058 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3095E9Q058 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3095E9Q058 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3095E9Q058 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3095E9Q058 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3095E9Q058 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3095E9Q058 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3095E9Q058 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3095E9Q058 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3095E9Q058 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3095E9Q058 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3095E9Q058 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3095E9Q058 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3095E9Q058 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3095E9Q058 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3095E9Q058 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3095E9Q058 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3095E9Q058 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3095E9Q058 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3095E9Q058 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3095E9Q058 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3095E9Q058 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3095E9Q058 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3095E9Q058 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3095E9Q058 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3095E9Q058 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3095E9Q058 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3095E9Q058 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3095E9Q058 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3095E9Q058 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm3095E9Q058 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm3095E9Q058 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm3095E9Q058 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm3095E9Q058 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm3095E9Q058 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3095E9Q058 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3095E9Q058 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3095E9Q058 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3095E9Q058 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3095E9Q058 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3095E9Q058 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3095E9Q058 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3095E9Q058 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3095E9Q058 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3095E9Q058 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3095E9Q058 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3095E9Q058 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3095E9Q058 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3095E9Q058 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3095E9Q058 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3095E9Q058 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3095E9Q058 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3095E9Q058 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3095E9Q058 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3095E9Q058 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3095E9Q058 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3095E9Q058 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3095E9Q058 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3095E9Q058 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3095E9Q058 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3095E9Q058 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3095E9Q058 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3095E9Q058 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3095E9Q058 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3095E9Q058 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3095E9Q058 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3095E9Q058 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3095E9Q058 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3095E9Q058 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3095E9Q058 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3095E9Q058 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm3095E9Q058 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm3095E9Q058 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm3095E9Q058 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms