Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T8

4930407I10Rik, RIKEN cDNA 4930407I10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930407I10RikD3Z5T8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
4930407I10RikD3Z5T8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
4930407I10RikD3Z5T8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
4930407I10RikD3Z5T8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
4930407I10RikD3Z5T8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
4930407I10RikD3Z5T8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
4930407I10RikD3Z5T8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
4930407I10RikD3Z5T8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
4930407I10RikD3Z5T8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
4930407I10RikD3Z5T8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
4930407I10RikD3Z5T8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
4930407I10RikD3Z5T8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
4930407I10RikD3Z5T8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
4930407I10RikD3Z5T8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
4930407I10RikD3Z5T8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
4930407I10RikD3Z5T8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
4930407I10RikD3Z5T8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
4930407I10RikD3Z5T8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
4930407I10RikD3Z5T8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
4930407I10RikD3Z5T8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
4930407I10RikD3Z5T8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
4930407I10RikD3Z5T8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
4930407I10RikD3Z5T8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
4930407I10RikD3Z5T8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
4930407I10RikD3Z5T8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
4930407I10RikD3Z5T8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
4930407I10RikD3Z5T8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
4930407I10RikD3Z5T8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
4930407I10RikD3Z5T8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
4930407I10RikD3Z5T8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
4930407I10RikD3Z5T8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
4930407I10RikD3Z5T8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
4930407I10RikD3Z5T8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
4930407I10RikD3Z5T8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
4930407I10RikD3Z5T8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
4930407I10RikD3Z5T8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
4930407I10RikD3Z5T8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
4930407I10RikD3Z5T8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
4930407I10RikD3Z5T8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
4930407I10RikD3Z5T8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
4930407I10RikD3Z5T8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
4930407I10RikD3Z5T8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
4930407I10RikD3Z5T8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
4930407I10RikD3Z5T8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
4930407I10RikD3Z5T8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
4930407I10RikD3Z5T8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
4930407I10RikD3Z5T8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
4930407I10RikD3Z5T8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
4930407I10RikD3Z5T8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
4930407I10RikD3Z5T8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
4930407I10RikD3Z5T8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
4930407I10RikD3Z5T8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
4930407I10RikD3Z5T8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
4930407I10RikD3Z5T8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
4930407I10RikD3Z5T8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
4930407I10RikD3Z5T8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
4930407I10RikD3Z5T8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
4930407I10RikD3Z5T8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
4930407I10RikD3Z5T8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
4930407I10RikD3Z5T8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
4930407I10RikD3Z5T8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
4930407I10RikD3Z5T8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
4930407I10RikD3Z5T8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
4930407I10RikD3Z5T8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
4930407I10RikD3Z5T8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
4930407I10RikD3Z5T8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
4930407I10RikD3Z5T8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
4930407I10RikD3Z5T8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
4930407I10RikD3Z5T8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
4930407I10RikD3Z5T8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
4930407I10RikD3Z5T8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
4930407I10RikD3Z5T8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
4930407I10RikD3Z5T8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
4930407I10RikD3Z5T8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
4930407I10RikD3Z5T8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
4930407I10RikD3Z5T8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
4930407I10RikD3Z5T8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
4930407I10RikD3Z5T8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
4930407I10RikD3Z5T8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
4930407I10RikD3Z5T8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
4930407I10RikD3Z5T8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
4930407I10RikD3Z5T8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
4930407I10RikD3Z5T8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
4930407I10RikD3Z5T8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
4930407I10RikD3Z5T8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
4930407I10RikD3Z5T8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
4930407I10RikD3Z5T8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
4930407I10RikD3Z5T8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
4930407I10RikD3Z5T8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
4930407I10RikD3Z5T8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
4930407I10RikD3Z5T8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
4930407I10RikD3Z5T8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
4930407I10RikD3Z5T8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
4930407I10RikD3Z5T8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
4930407I10RikD3Z5T8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
4930407I10RikD3Z5T8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
4930407I10RikD3Z5T8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
4930407I10RikD3Z5T8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
4930407I10RikD3Z5T8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms