Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Samd1D3YXK1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Samd1D3YXK1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 168.9 ms