Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppfia1B2RXQ2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppfia1B2RXQ2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppfia1B2RXQ2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppfia1B2RXQ2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppfia1B2RXQ2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppfia1B2RXQ2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppfia1B2RXQ2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppfia1B2RXQ2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppfia1B2RXQ2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppfia1B2RXQ2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppfia1B2RXQ2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppfia1B2RXQ2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppfia1B2RXQ2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppfia1B2RXQ2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppfia1B2RXQ2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppfia1B2RXQ2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppfia1B2RXQ2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppfia1B2RXQ2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppfia1B2RXQ2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppfia1B2RXQ2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppfia1B2RXQ2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppfia1B2RXQ2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppfia1B2RXQ2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppfia1B2RXQ2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppfia1B2RXQ2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppfia1B2RXQ2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppfia1B2RXQ2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppfia1B2RXQ2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppfia1B2RXQ2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppfia1B2RXQ2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppfia1B2RXQ2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppfia1B2RXQ2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ppfia1B2RXQ2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ppfia1B2RXQ2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ppfia1B2RXQ2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppfia1B2RXQ2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppfia1B2RXQ2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppfia1B2RXQ2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppfia1B2RXQ2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppfia1B2RXQ2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppfia1B2RXQ2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppfia1B2RXQ2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppfia1B2RXQ2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppfia1B2RXQ2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppfia1B2RXQ2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppfia1B2RXQ2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppfia1B2RXQ2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppfia1B2RXQ2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppfia1B2RXQ2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppfia1B2RXQ2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppfia1B2RXQ2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppfia1B2RXQ2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppfia1B2RXQ2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppfia1B2RXQ2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppfia1B2RXQ2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppfia1B2RXQ2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppfia1B2RXQ2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppfia1B2RXQ2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppfia1B2RXQ2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppfia1B2RXQ2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppfia1B2RXQ2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppfia1B2RXQ2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppfia1B2RXQ2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppfia1B2RXQ2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppfia1B2RXQ2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppfia1B2RXQ2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppfia1B2RXQ2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppfia1B2RXQ2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppfia1B2RXQ2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppfia1B2RXQ2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppfia1B2RXQ2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppfia1B2RXQ2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppfia1B2RXQ2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppfia1B2RXQ2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppfia1B2RXQ2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppfia1B2RXQ2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppfia1B2RXQ2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppfia1B2RXQ2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppfia1B2RXQ2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppfia1B2RXQ2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppfia1B2RXQ2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppfia1B2RXQ2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppfia1B2RXQ2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppfia1B2RXQ2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppfia1B2RXQ2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppfia1B2RXQ2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppfia1B2RXQ2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppfia1B2RXQ2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppfia1B2RXQ2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppfia1B2RXQ2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppfia1B2RXQ2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppfia1B2RXQ2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppfia1B2RXQ2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ppfia1B2RXQ2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ppfia1B2RXQ2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ppfia1B2RXQ2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ppfia1B2RXQ2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ppfia1B2RXQ2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppfia1B2RXQ2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms