Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Slfn8B1ARD8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Slfn8B1ARD8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Slfn8B1ARD8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Slfn8B1ARD8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Slfn8B1ARD8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slfn8B1ARD8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slfn8B1ARD8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slfn8B1ARD8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slfn8B1ARD8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slfn8B1ARD8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slfn8B1ARD8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slfn8B1ARD8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slfn8B1ARD8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slfn8B1ARD8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slfn8B1ARD8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slfn8B1ARD8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slfn8B1ARD8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slfn8B1ARD8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slfn8B1ARD8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slfn8B1ARD8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slfn8B1ARD8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slfn8B1ARD8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slfn8B1ARD8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Slfn8B1ARD8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slfn8B1ARD8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slfn8B1ARD8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Slfn8B1ARD8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slfn8B1ARD8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slfn8B1ARD8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slfn8B1ARD8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slfn8B1ARD8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slfn8B1ARD8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slfn8B1ARD8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slfn8B1ARD8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slfn8B1ARD8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slfn8B1ARD8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slfn8B1ARD8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slfn8B1ARD8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slfn8B1ARD8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slfn8B1ARD8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slfn8B1ARD8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slfn8B1ARD8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slfn8B1ARD8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slfn8B1ARD8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slfn8B1ARD8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slfn8B1ARD8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slfn8B1ARD8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slfn8B1ARD8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slfn8B1ARD8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slfn8B1ARD8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Slfn8B1ARD8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slfn8B1ARD8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms