Protein–RNA interactions for Protein: A2RT60

Htra4, Serine protease HTRA4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra4A2RT60 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Htra4A2RT60 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms