Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Syndig1A2ANU3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Syndig1A2ANU3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms