Protein–RNA interactions for Protein: A2ANE1

Rhox3f, Reproductive homeobox 3F, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3fA2ANE1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rhox3fA2ANE1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rhox3fA2ANE1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rhox3fA2ANE1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Rhox3fA2ANE1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rhox3fA2ANE1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rhox3fA2ANE1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Rhox3fA2ANE1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rhox3fA2ANE1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rhox3fA2ANE1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rhox3fA2ANE1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rhox3fA2ANE1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rhox3fA2ANE1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rhox3fA2ANE1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rhox3fA2ANE1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rhox3fA2ANE1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rhox3fA2ANE1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rhox3fA2ANE1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rhox3fA2ANE1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rhox3fA2ANE1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhox3fA2ANE1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhox3fA2ANE1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhox3fA2ANE1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhox3fA2ANE1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhox3fA2ANE1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhox3fA2ANE1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhox3fA2ANE1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhox3fA2ANE1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhox3fA2ANE1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhox3fA2ANE1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhox3fA2ANE1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhox3fA2ANE1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhox3fA2ANE1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhox3fA2ANE1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhox3fA2ANE1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhox3fA2ANE1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhox3fA2ANE1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhox3fA2ANE1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rhox3fA2ANE1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rhox3fA2ANE1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rhox3fA2ANE1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rhox3fA2ANE1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rhox3fA2ANE1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rhox3fA2ANE1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rhox3fA2ANE1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rhox3fA2ANE1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rhox3fA2ANE1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Rhox3fA2ANE1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rhox3fA2ANE1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rhox3fA2ANE1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rhox3fA2ANE1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rhox3fA2ANE1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Rhox3fA2ANE1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rhox3fA2ANE1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rhox3fA2ANE1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rhox3fA2ANE1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rhox3fA2ANE1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rhox3fA2ANE1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rhox3fA2ANE1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rhox3fA2ANE1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rhox3fA2ANE1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rhox3fA2ANE1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rhox3fA2ANE1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rhox3fA2ANE1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rhox3fA2ANE1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rhox3fA2ANE1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Rhox3fA2ANE1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rhox3fA2ANE1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rhox3fA2ANE1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rhox3fA2ANE1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rhox3fA2ANE1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rhox3fA2ANE1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rhox3fA2ANE1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rhox3fA2ANE1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rhox3fA2ANE1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rhox3fA2ANE1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rhox3fA2ANE1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rhox3fA2ANE1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rhox3fA2ANE1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rhox3fA2ANE1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rhox3fA2ANE1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rhox3fA2ANE1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rhox3fA2ANE1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rhox3fA2ANE1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rhox3fA2ANE1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rhox3fA2ANE1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rhox3fA2ANE1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rhox3fA2ANE1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rhox3fA2ANE1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rhox3fA2ANE1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rhox3fA2ANE1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rhox3fA2ANE1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rhox3fA2ANE1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rhox3fA2ANE1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rhox3fA2ANE1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rhox3fA2ANE1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rhox3fA2ANE1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rhox3fA2ANE1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rhox3fA2ANE1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rhox3fA2ANE1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms