Protein–RNA interactions for Protein: A2ALV5

AI481877, Expressed sequence AI481877, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AI481877A2ALV5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
AI481877A2ALV5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
AI481877A2ALV5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
AI481877A2ALV5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
AI481877A2ALV5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
AI481877A2ALV5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
AI481877A2ALV5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
AI481877A2ALV5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
AI481877A2ALV5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
AI481877A2ALV5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
AI481877A2ALV5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
AI481877A2ALV5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
AI481877A2ALV5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
AI481877A2ALV5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
AI481877A2ALV5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
AI481877A2ALV5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
AI481877A2ALV5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
AI481877A2ALV5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
AI481877A2ALV5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
AI481877A2ALV5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
AI481877A2ALV5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
AI481877A2ALV5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
AI481877A2ALV5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
AI481877A2ALV5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
AI481877A2ALV5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
AI481877A2ALV5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
AI481877A2ALV5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
AI481877A2ALV5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
AI481877A2ALV5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
AI481877A2ALV5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
AI481877A2ALV5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
AI481877A2ALV5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
AI481877A2ALV5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
AI481877A2ALV5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
AI481877A2ALV5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
AI481877A2ALV5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
AI481877A2ALV5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
AI481877A2ALV5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
AI481877A2ALV5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
AI481877A2ALV5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
AI481877A2ALV5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
AI481877A2ALV5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
AI481877A2ALV5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
AI481877A2ALV5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.53
AI481877A2ALV5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
AI481877A2ALV5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
AI481877A2ALV5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
AI481877A2ALV5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
AI481877A2ALV5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
AI481877A2ALV5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
AI481877A2ALV5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
AI481877A2ALV5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
AI481877A2ALV5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
AI481877A2ALV5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
AI481877A2ALV5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
AI481877A2ALV5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
AI481877A2ALV5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
AI481877A2ALV5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
AI481877A2ALV5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
AI481877A2ALV5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
AI481877A2ALV5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
AI481877A2ALV5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
AI481877A2ALV5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
AI481877A2ALV5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
AI481877A2ALV5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
AI481877A2ALV5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
AI481877A2ALV5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
AI481877A2ALV5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
AI481877A2ALV5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
AI481877A2ALV5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
AI481877A2ALV5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
AI481877A2ALV5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
AI481877A2ALV5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
AI481877A2ALV5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
AI481877A2ALV5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
AI481877A2ALV5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
AI481877A2ALV5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
AI481877A2ALV5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
AI481877A2ALV5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
AI481877A2ALV5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
AI481877A2ALV5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
AI481877A2ALV5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
AI481877A2ALV5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
AI481877A2ALV5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
AI481877A2ALV5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
AI481877A2ALV5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
AI481877A2ALV5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
AI481877A2ALV5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
AI481877A2ALV5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
AI481877A2ALV5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
AI481877A2ALV5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
AI481877A2ALV5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
AI481877A2ALV5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
AI481877A2ALV5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
AI481877A2ALV5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
AI481877A2ALV5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
AI481877A2ALV5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
AI481877A2ALV5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
AI481877A2ALV5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
AI481877A2ALV5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms