Protein–RNA interactions for Protein: A2AKE5

1700003F12Rik, RIKEN cDNA 1700003F12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700003F12RikA2AKE5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700003F12RikA2AKE5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700003F12RikA2AKE5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700003F12RikA2AKE5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700003F12RikA2AKE5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700003F12RikA2AKE5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700003F12RikA2AKE5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700003F12RikA2AKE5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
1700003F12RikA2AKE5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700003F12RikA2AKE5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700003F12RikA2AKE5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700003F12RikA2AKE5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
1700003F12RikA2AKE5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
1700003F12RikA2AKE5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
1700003F12RikA2AKE5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
1700003F12RikA2AKE5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700003F12RikA2AKE5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700003F12RikA2AKE5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700003F12RikA2AKE5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700003F12RikA2AKE5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700003F12RikA2AKE5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700003F12RikA2AKE5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700003F12RikA2AKE5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700003F12RikA2AKE5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700003F12RikA2AKE5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1700003F12RikA2AKE5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1700003F12RikA2AKE5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
1700003F12RikA2AKE5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1700003F12RikA2AKE5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1700003F12RikA2AKE5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
1700003F12RikA2AKE5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
1700003F12RikA2AKE5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
1700003F12RikA2AKE5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700003F12RikA2AKE5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700003F12RikA2AKE5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700003F12RikA2AKE5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
1700003F12RikA2AKE5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700003F12RikA2AKE5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700003F12RikA2AKE5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700003F12RikA2AKE5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700003F12RikA2AKE5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700003F12RikA2AKE5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700003F12RikA2AKE5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700003F12RikA2AKE5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
1700003F12RikA2AKE5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700003F12RikA2AKE5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700003F12RikA2AKE5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700003F12RikA2AKE5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700003F12RikA2AKE5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700003F12RikA2AKE5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
1700003F12RikA2AKE5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
1700003F12RikA2AKE5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
1700003F12RikA2AKE5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700003F12RikA2AKE5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700003F12RikA2AKE5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
1700003F12RikA2AKE5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700003F12RikA2AKE5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700003F12RikA2AKE5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700003F12RikA2AKE5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700003F12RikA2AKE5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700003F12RikA2AKE5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700003F12RikA2AKE5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
1700003F12RikA2AKE5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
1700003F12RikA2AKE5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
1700003F12RikA2AKE5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
1700003F12RikA2AKE5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
1700003F12RikA2AKE5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
1700003F12RikA2AKE5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
1700003F12RikA2AKE5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
1700003F12RikA2AKE5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
1700003F12RikA2AKE5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
1700003F12RikA2AKE5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
1700003F12RikA2AKE5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
1700003F12RikA2AKE5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
1700003F12RikA2AKE5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
1700003F12RikA2AKE5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
1700003F12RikA2AKE5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
1700003F12RikA2AKE5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
1700003F12RikA2AKE5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
1700003F12RikA2AKE5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
1700003F12RikA2AKE5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
1700003F12RikA2AKE5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
1700003F12RikA2AKE5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700003F12RikA2AKE5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700003F12RikA2AKE5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700003F12RikA2AKE5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
1700003F12RikA2AKE5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700003F12RikA2AKE5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700003F12RikA2AKE5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
1700003F12RikA2AKE5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
1700003F12RikA2AKE5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
1700003F12RikA2AKE5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
1700003F12RikA2AKE5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
1700003F12RikA2AKE5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
1700003F12RikA2AKE5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
1700003F12RikA2AKE5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
1700003F12RikA2AKE5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
1700003F12RikA2AKE5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
1700003F12RikA2AKE5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
1700003F12RikA2AKE5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms