Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Frmpd1A2AKB4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Frmpd1A2AKB4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Frmpd1A2AKB4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
Frmpd1A2AKB4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Frmpd1A2AKB4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Frmpd1A2AKB4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Frmpd1A2AKB4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Frmpd1A2AKB4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Frmpd1A2AKB4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Frmpd1A2AKB4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Frmpd1A2AKB4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Frmpd1A2AKB4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Frmpd1A2AKB4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Frmpd1A2AKB4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Frmpd1A2AKB4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Frmpd1A2AKB4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Frmpd1A2AKB4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Frmpd1A2AKB4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
Frmpd1A2AKB4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
Frmpd1A2AKB4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Frmpd1A2AKB4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Frmpd1A2AKB4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Frmpd1A2AKB4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
Frmpd1A2AKB4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Frmpd1A2AKB4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Frmpd1A2AKB4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Frmpd1A2AKB4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Frmpd1A2AKB4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Frmpd1A2AKB4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Frmpd1A2AKB4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Frmpd1A2AKB4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Frmpd1A2AKB4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Frmpd1A2AKB4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Frmpd1A2AKB4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Frmpd1A2AKB4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Frmpd1A2AKB4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Frmpd1A2AKB4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Frmpd1A2AKB4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Frmpd1A2AKB4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
Frmpd1A2AKB4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Frmpd1A2AKB4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Frmpd1A2AKB4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Frmpd1A2AKB4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Frmpd1A2AKB4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Frmpd1A2AKB4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Frmpd1A2AKB4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Frmpd1A2AKB4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Frmpd1A2AKB4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Frmpd1A2AKB4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Frmpd1A2AKB4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Frmpd1A2AKB4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Frmpd1A2AKB4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Frmpd1A2AKB4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Frmpd1A2AKB4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Frmpd1A2AKB4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Frmpd1A2AKB4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Frmpd1A2AKB4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Frmpd1A2AKB4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Frmpd1A2AKB4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Frmpd1A2AKB4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
Frmpd1A2AKB4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Frmpd1A2AKB4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Frmpd1A2AKB4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Frmpd1A2AKB4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
Frmpd1A2AKB4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Frmpd1A2AKB4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Frmpd1A2AKB4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Frmpd1A2AKB4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
Frmpd1A2AKB4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Frmpd1A2AKB4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Frmpd1A2AKB4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Frmpd1A2AKB4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Frmpd1A2AKB4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Frmpd1A2AKB4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Frmpd1A2AKB4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Frmpd1A2AKB4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Frmpd1A2AKB4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
Frmpd1A2AKB4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Frmpd1A2AKB4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Frmpd1A2AKB4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Frmpd1A2AKB4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Frmpd1A2AKB4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Frmpd1A2AKB4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Frmpd1A2AKB4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Frmpd1A2AKB4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Frmpd1A2AKB4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Frmpd1A2AKB4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Frmpd1A2AKB4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Frmpd1A2AKB4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Frmpd1A2AKB4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Frmpd1A2AKB4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Frmpd1A2AKB4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Frmpd1A2AKB4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Frmpd1A2AKB4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Frmpd1A2AKB4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Frmpd1A2AKB4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Frmpd1A2AKB4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
Frmpd1A2AKB4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
Frmpd1A2AKB4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms