Protein–RNA interactions for Protein: A2AHJ4

Brwd3, Bromodomain and WD repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brwd3A2AHJ4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Brwd3A2AHJ4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Brwd3A2AHJ4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Brwd3A2AHJ4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Brwd3A2AHJ4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Brwd3A2AHJ4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Brwd3A2AHJ4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Brwd3A2AHJ4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Brwd3A2AHJ4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Brwd3A2AHJ4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Brwd3A2AHJ4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Brwd3A2AHJ4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Brwd3A2AHJ4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Brwd3A2AHJ4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Brwd3A2AHJ4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Brwd3A2AHJ4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Brwd3A2AHJ4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Brwd3A2AHJ4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Brwd3A2AHJ4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Brwd3A2AHJ4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Brwd3A2AHJ4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Brwd3A2AHJ4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Brwd3A2AHJ4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Brwd3A2AHJ4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Brwd3A2AHJ4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Brwd3A2AHJ4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Brwd3A2AHJ4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Brwd3A2AHJ4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Brwd3A2AHJ4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Brwd3A2AHJ4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Brwd3A2AHJ4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Brwd3A2AHJ4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Brwd3A2AHJ4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Brwd3A2AHJ4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Brwd3A2AHJ4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Brwd3A2AHJ4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Brwd3A2AHJ4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Brwd3A2AHJ4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Brwd3A2AHJ4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Brwd3A2AHJ4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Brwd3A2AHJ4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Brwd3A2AHJ4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Brwd3A2AHJ4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Brwd3A2AHJ4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Brwd3A2AHJ4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Brwd3A2AHJ4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Brwd3A2AHJ4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Brwd3A2AHJ4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Brwd3A2AHJ4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Brwd3A2AHJ4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Brwd3A2AHJ4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Brwd3A2AHJ4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Brwd3A2AHJ4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Brwd3A2AHJ4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Brwd3A2AHJ4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Brwd3A2AHJ4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Brwd3A2AHJ4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Brwd3A2AHJ4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Brwd3A2AHJ4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Brwd3A2AHJ4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Brwd3A2AHJ4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Brwd3A2AHJ4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Brwd3A2AHJ4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Brwd3A2AHJ4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Brwd3A2AHJ4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Brwd3A2AHJ4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Brwd3A2AHJ4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Brwd3A2AHJ4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Brwd3A2AHJ4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Brwd3A2AHJ4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Brwd3A2AHJ4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Brwd3A2AHJ4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Brwd3A2AHJ4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Brwd3A2AHJ4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Brwd3A2AHJ4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Brwd3A2AHJ4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Brwd3A2AHJ4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Brwd3A2AHJ4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Brwd3A2AHJ4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Brwd3A2AHJ4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Brwd3A2AHJ4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Brwd3A2AHJ4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Brwd3A2AHJ4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Brwd3A2AHJ4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Brwd3A2AHJ4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Brwd3A2AHJ4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Brwd3A2AHJ4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Brwd3A2AHJ4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Brwd3A2AHJ4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Brwd3A2AHJ4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Brwd3A2AHJ4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Brwd3A2AHJ4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Brwd3A2AHJ4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Brwd3A2AHJ4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Brwd3A2AHJ4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Brwd3A2AHJ4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Brwd3A2AHJ4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Brwd3A2AHJ4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Brwd3A2AHJ4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Brwd3A2AHJ4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.1 ms