Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc163A2AGD7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc163A2AGD7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc163A2AGD7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc163A2AGD7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc163A2AGD7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc163A2AGD7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc163A2AGD7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc163A2AGD7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc163A2AGD7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc163A2AGD7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc163A2AGD7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc163A2AGD7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc163A2AGD7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc163A2AGD7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc163A2AGD7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc163A2AGD7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc163A2AGD7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc163A2AGD7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc163A2AGD7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc163A2AGD7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc163A2AGD7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc163A2AGD7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc163A2AGD7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc163A2AGD7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc163A2AGD7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc163A2AGD7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc163A2AGD7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc163A2AGD7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc163A2AGD7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc163A2AGD7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc163A2AGD7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc163A2AGD7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc163A2AGD7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc163A2AGD7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc163A2AGD7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc163A2AGD7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc163A2AGD7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc163A2AGD7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc163A2AGD7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc163A2AGD7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc163A2AGD7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc163A2AGD7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc163A2AGD7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc163A2AGD7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc163A2AGD7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc163A2AGD7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc163A2AGD7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc163A2AGD7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc163A2AGD7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc163A2AGD7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc163A2AGD7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc163A2AGD7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc163A2AGD7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc163A2AGD7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc163A2AGD7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc163A2AGD7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc163A2AGD7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc163A2AGD7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc163A2AGD7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc163A2AGD7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc163A2AGD7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc163A2AGD7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc163A2AGD7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc163A2AGD7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc163A2AGD7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc163A2AGD7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc163A2AGD7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc163A2AGD7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc163A2AGD7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc163A2AGD7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc163A2AGD7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc163A2AGD7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc163A2AGD7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc163A2AGD7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc163A2AGD7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc163A2AGD7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc163A2AGD7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc163A2AGD7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc163A2AGD7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc163A2AGD7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc163A2AGD7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc163A2AGD7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc163A2AGD7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc163A2AGD7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc163A2AGD7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc163A2AGD7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc163A2AGD7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc163A2AGD7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc163A2AGD7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc163A2AGD7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc163A2AGD7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc163A2AGD7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc163A2AGD7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc163A2AGD7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc163A2AGD7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc163A2AGD7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc163A2AGD7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc163A2AGD7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc163A2AGD7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms