Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Frmpd4A2AFR3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Frmpd4A2AFR3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Frmpd4A2AFR3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Frmpd4A2AFR3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Frmpd4A2AFR3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Frmpd4A2AFR3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Frmpd4A2AFR3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Frmpd4A2AFR3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Frmpd4A2AFR3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Frmpd4A2AFR3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Frmpd4A2AFR3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Frmpd4A2AFR3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Frmpd4A2AFR3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Frmpd4A2AFR3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Frmpd4A2AFR3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Frmpd4A2AFR3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Frmpd4A2AFR3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Frmpd4A2AFR3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Frmpd4A2AFR3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Frmpd4A2AFR3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Frmpd4A2AFR3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Frmpd4A2AFR3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Frmpd4A2AFR3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Frmpd4A2AFR3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Frmpd4A2AFR3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Frmpd4A2AFR3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Frmpd4A2AFR3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Frmpd4A2AFR3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Frmpd4A2AFR3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Frmpd4A2AFR3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Frmpd4A2AFR3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Frmpd4A2AFR3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Frmpd4A2AFR3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Frmpd4A2AFR3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Frmpd4A2AFR3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Frmpd4A2AFR3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Frmpd4A2AFR3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Frmpd4A2AFR3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Frmpd4A2AFR3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Frmpd4A2AFR3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Frmpd4A2AFR3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Frmpd4A2AFR3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Frmpd4A2AFR3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Frmpd4A2AFR3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Frmpd4A2AFR3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Frmpd4A2AFR3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Frmpd4A2AFR3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Frmpd4A2AFR3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Frmpd4A2AFR3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Frmpd4A2AFR3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Frmpd4A2AFR3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Frmpd4A2AFR3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Frmpd4A2AFR3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Frmpd4A2AFR3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Frmpd4A2AFR3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Frmpd4A2AFR3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Frmpd4A2AFR3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Frmpd4A2AFR3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Frmpd4A2AFR3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Frmpd4A2AFR3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Frmpd4A2AFR3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Frmpd4A2AFR3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Frmpd4A2AFR3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Frmpd4A2AFR3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Frmpd4A2AFR3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Frmpd4A2AFR3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Frmpd4A2AFR3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Frmpd4A2AFR3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Frmpd4A2AFR3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Frmpd4A2AFR3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Frmpd4A2AFR3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Frmpd4A2AFR3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Frmpd4A2AFR3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Frmpd4A2AFR3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Frmpd4A2AFR3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Frmpd4A2AFR3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Frmpd4A2AFR3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Frmpd4A2AFR3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Frmpd4A2AFR3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Frmpd4A2AFR3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Frmpd4A2AFR3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Frmpd4A2AFR3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Frmpd4A2AFR3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Frmpd4A2AFR3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Frmpd4A2AFR3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Frmpd4A2AFR3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Frmpd4A2AFR3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Frmpd4A2AFR3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Frmpd4A2AFR3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Frmpd4A2AFR3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Frmpd4A2AFR3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Frmpd4A2AFR3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Frmpd4A2AFR3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Frmpd4A2AFR3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Frmpd4A2AFR3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Frmpd4A2AFR3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Frmpd4A2AFR3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Frmpd4A2AFR3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Frmpd4A2AFR3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms