Protein–RNA interactions for Protein: A2A588

Krtap1-3, Keratin-associated protein 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap1-3A2A588 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Krtap1-3A2A588 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Krtap1-3A2A588 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Krtap1-3A2A588 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Krtap1-3A2A588 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Krtap1-3A2A588 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Krtap1-3A2A588 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Krtap1-3A2A588 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms