Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1K3

B230359F08Rik, RIKEN cDNA B230359F08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms