Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Gm37858-201ENSMUST00000192759 1231 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Gm18382-201ENSMUST00000194394 582 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Gm34701-202ENSMUST00000204685 360 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Gm44200-201ENSMUST00000204883 662 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 RMST_1.1-211ENSMUST00000219726 783 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Prl8a8-202ENSMUST00000110350 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Gm16044-201ENSMUST00000118475 450 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Gm15719-201ENSMUST00000120619 635 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Gm15529-201ENSMUST00000121833 994 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Gm17611-202ENSMUST00000220613 814 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 AC174797.4-201ENSMUST00000225510 347 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Otud1Q9CUB6 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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