Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

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Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm26208-201ENSMUST00000158677 124 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdm1Q9CQK3 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdm1Q9CQK3 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdm1Q9CQK3 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdm1Q9CQK3 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdm1Q9CQK3 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdm1Q9CQK3 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdm1Q9CQK3 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdm1Q9CQK3 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdm1Q9CQK3 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdm1Q9CQK3 Mir291b-201ENSMUST00000104838 79 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdm1Q9CQK3 Gm12397-201ENSMUST00000117674 615 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdm1Q9CQK3 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdm1Q9CQK3 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdm1Q9CQK3 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdm1Q9CQK3 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdm1Q9CQK3 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdm1Q9CQK3 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdm1Q9CQK3 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdm1Q9CQK3 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdm1Q9CQK3 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdm1Q9CQK3 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdm1Q9CQK3 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdm1Q9CQK3 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdm1Q9CQK3 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdm1Q9CQK3 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdm1Q9CQK3 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdm1Q9CQK3 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdm1Q9CQK3 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdm1Q9CQK3 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdm1Q9CQK3 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdm1Q9CQK3 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdm1Q9CQK3 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdm1Q9CQK3 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rdm1Q9CQK3 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms