Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 4930432K21Rik-201ENSMUST00000093375 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Fndc7-202ENSMUST00000102620 3477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Spata16-201ENSMUST00000047005 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm32219-201ENSMUST00000221234 1819 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gpm6b-201ENSMUST00000060210 2858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Ctsa-202ENSMUST00000103092 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm26625-201ENSMUST00000181519 2538 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Prmt7-201ENSMUST00000071592 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Duoxa1-203ENSMUST00000110538 2467 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm44798-201ENSMUST00000208123 2410 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Supt20-201ENSMUST00000029315 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Zc3h7a-201ENSMUST00000037633 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Evc-203ENSMUST00000114154 3695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Tnfrsf8-201ENSMUST00000030339 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Adam1b-201ENSMUST00000079368 3338 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 St5-203ENSMUST00000084738 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 St5-204ENSMUST00000168005 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm45867-201ENSMUST00000208201 2317 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Hapln3-203ENSMUST00000206092 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Galnt16-201ENSMUST00000021558 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Thsd7b-201ENSMUST00000040311 3895 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Tmem63a-205ENSMUST00000161523 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm45768-201ENSMUST00000206763 3202 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Fam122b-201ENSMUST00000071023 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Rd3-202ENSMUST00000180463 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Igf2bp2-202ENSMUST00000115379 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Fadd-201ENSMUST00000033394 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pacsin3Q99JB8 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms