Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Cd200r2-201ENSMUST00000102805 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Sgk2-202ENSMUST00000117123 3034 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 March1-206ENSMUST00000110256 3288 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm9978-201ENSMUST00000069431 3273 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Ctage5-220ENSMUST00000177225 2872 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm45336-201ENSMUST00000210010 3230 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Unc13d-209ENSMUST00000174822 3337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 4931406P16Rik-202ENSMUST00000108074 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm30132-201ENSMUST00000212816 8757 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Pde9a-206ENSMUST00000134525 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Dlgap4-206ENSMUST00000109568 3256 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Plekhb2-201ENSMUST00000027297 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Lmbrd1-206ENSMUST00000191471 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Tgm7-201ENSMUST00000110675 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm14372-201ENSMUST00000125355 2193 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm38054-201ENSMUST00000192380 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Smarcc2-202ENSMUST00000099131 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm45797-201ENSMUST00000212759 1921 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Cish-201ENSMUST00000085102 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Adam22-204ENSMUST00000088761 9077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 A430105I19Rik-201ENSMUST00000059997 4703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Sh3tc1-207ENSMUST00000201511 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gpr75-201ENSMUST00000109430 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Kdm4a-201ENSMUST00000050288 3279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Dnmt1-202ENSMUST00000177754 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Prmt7-201ENSMUST00000071592 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Inpp4a-207ENSMUST00000136846 3576 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Nfam1-202ENSMUST00000100377 2881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm15953-201ENSMUST00000117656 1732 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Padi3-202ENSMUST00000172098 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Nkiras1-202ENSMUST00000132374 4598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Mc3r-201ENSMUST00000038532 2623 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Adgra1-201ENSMUST00000026548 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Tbc1d14-203ENSMUST00000126077 4085 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Il6st-210ENSMUST00000184949 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm42979-201ENSMUST00000196287 2228 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Prkag2-201ENSMUST00000030784 3331 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Slc2a4rg-ps-201ENSMUST00000127559 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Iqgap3-204ENSMUST00000194440 3263 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Olfm4-203ENSMUST00000228749 2801 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm45837-201ENSMUST00000084894 4139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm26751-201ENSMUST00000181218 4245 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Zfp398-202ENSMUST00000114598 8328 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Cyp4a12b-201ENSMUST00000094887 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Fcamr-201ENSMUST00000027670 1743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Anln-201ENSMUST00000040912 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Lama3-201ENSMUST00000092070 10548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm44926-201ENSMUST00000207898 1826 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Tns1-201ENSMUST00000169786 9966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Zbtb3-201ENSMUST00000172175 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 3632454L22Rik-202ENSMUST00000153610 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms