Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Usp48Q3V0C5 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Gm22388-201ENSMUST00000158194 248 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 4930573C15Rik-201ENSMUST00000197707 777 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Usp48Q3V0C5 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Usp48Q3V0C5 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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Usp48Q3V0C5 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Usp48Q3V0C5 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Usp48Q3V0C5 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Usp48Q3V0C5 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Tipin-205ENSMUST00000216594 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Usp48Q3V0C5 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Usp48Q3V0C5 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Usp48Q3V0C5 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Usp48Q3V0C5 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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