Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Uspl1-202ENSMUST00000100410 3148 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Kat7-204ENSMUST00000107733 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gpm6b-205ENSMUST00000112227 3294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Sun1-204ENSMUST00000110882 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 4932442E05Rik-201ENSMUST00000191892 2717 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Kif3a-202ENSMUST00000118353 2178 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Epb41l4a-201ENSMUST00000025234 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm44798-201ENSMUST00000208123 2410 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gripap1-201ENSMUST00000065932 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Duoxa1-203ENSMUST00000110538 2467 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Spats2l-206ENSMUST00000167085 3929 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Anks1b-210ENSMUST00000182113 3553 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Rnft1-201ENSMUST00000020827 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Kcnv1-201ENSMUST00000022967 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Tomm20-201ENSMUST00000179857 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gmip-201ENSMUST00000036074 3933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Prkd3-204ENSMUST00000119284 4743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Bub1b-201ENSMUST00000038341 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Esrp2-201ENSMUST00000115979 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms